Badanie histopatologiczne – laboratoryjne badanie materiału biologicznego pobranego od pacjenta (np. polipa, wycinka błony śluzowej, fragmentu guza, itd.). Badanie histopatologiczne wykonuje się w celu określenia charakteru danej zmiany, np. czy jest to zmiana nowotworowa, zapalna, zwyrodnieniowa lub inna.
Badanie histopatologiczne to badanie mikroskopowe, aczkolwiek w bardziej skomplikowanych przypadkach może być ono rozszerzone o inne techniki, przy czym w języku potocznym całą grupę takich badań pobranych próbek określa się mianem histopatologii. Badaniom histopatologicznym poddawane są próbki pobierane w trakcie biopsji, polipy usuwane w trakcie polipektomii, itd.