Biopsja podczas endoskopii – metoda diagnostyczna polegająca na pobraniu próbek tkanek (np. błony śluzowej) w celu poddania ich badaniu histopatologicznemu (lub innym specjalistycznym badaniom). Biopsję można wykonywać w czasie zwykłego zabiegu endoskopowego (np. podczas kolonoskopii czy gastroskopii).